政府説明責任局（Government Accountability Office: GAO）が発表した報告書「バイオメディカル研究：NIHは間接費の増加がミッションに及ぼす影響について評価すべき（Biomedical Research: NIH Should Assess the Impact of Growth in Indirect Costs on Its Mission）」によれば、2002年度から2012年度の間に国立衛生研究所（National Institutes of Health: NIH）が大学に償還した間接費の増加率（28.1％）は、直接費の増加率（27％）に比べるとわずかに高いという。ただし、2003年度から2012年度の間で見ると、間接費の増加率（16.9％）が直接費の増加率（11％）を大きく上回っている。また、GAOのインタビュー調査を受けた大学や厚生省（Department of Health and Human Services: HHS）の高官、その他の関係者は、間接費増加の要因について、いくつか指摘しており、これを受けてGAOはNIHに対して、間接費の増加がミッションに及ぼす影響について評価するよう勧告している。
Government Accountability Office “Biomedical Research: NIH Should Assess the Impact of Growth in Indirect Costs on Its Mission” (9/24/13)