シンプルなモデル生物の動きは部分的にシミュレーションすることができるが、知識の溝は依然として存在する。更に、大腸菌などのより複雑な生物のシミュレーションは依然として捉えがたい。国防高等研究計画局(Defense Advanced Research Project Agency: DARPA)による「微生物システムのシミュレーション(Simulating Microbial Systems: SMS)」プログラムは、様々な状況においてバクテリアの動きを正確に予測するコンピュテーショナル・シミュレーションを創出することを目指す。具体的には、①ハイスループットで自動化された実験試験台と、②先端のコンピュテーショナル技法という2つの広範な領域における最近のイノベーションを活用し、包括的で一般化が可能な大腸菌のシミュレーションを創出することを目指す。